Hace años, todos los fantasmas en una escuela encantada fueron expulsados por un determinado alumno. Ahora, están de vuelta-y quieren venganza. Satsuki y Keiichirou Miyanoshita son dos hermanos que se recuperan de la trágica pérdida de su madre. Después de trasladarse a la ciudad natal de su madre, se enteran de que la escuela local les hayan transferido es un edificio antiguo y uno dice que es perseguido. A pesar de que inicialmente el cepillado apagado como un rumor tonto, los dos pronto descubre que los fantasmas son reales y que están detrás de ellos! Gakkou no Kaidan es la historia espeluznante de la vida de estos hermanos y sus nuevos amigos mientras tratan de sobrevivir con fantasmas-de la escuela un poco de ayuda de su gato a lo largo del camino.